Protein–RNA interactions for Protein: Q16515

ASIC2, Acid-sensing ion channel 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC2Q16515 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASIC2Q16515 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASIC2Q16515 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASIC2Q16515 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ASIC2Q16515 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms