Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKD1Q15139 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRKD1Q15139 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRKD1Q15139 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRKD1Q15139 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
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