Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TUBA3CQ13748 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TUBA3CQ13748 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TUBA3CQ13748 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TUBA3CQ13748 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
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