Protein–RNA interactions for Protein: Q13405

MRPL49, 39S ribosomal protein L49, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL49Q13405 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MRPL49Q13405 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPL49Q13405 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPL49Q13405 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPL49Q13405 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
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