Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KLF1Q13351 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KLF1Q13351 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KLF1Q13351 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KLF1Q13351 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
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