Protein–RNA interactions for Protein: Q12368

SNU23, 23 kDa U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein component, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNU23Q12368 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 SUF23tG(GCC)J2 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 SUF17tG(GCC)O2 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 TRP5YGL026C 2124 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 MAL11YGR289C 1851 nt5.6□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 YJL064WYJL064W 396 nt5.59□□□□□ -1.51
SNU23Q12368 GSY2YLR258W 2118 nt5.59□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 PYC2YBR218C 3543 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YDL177CYDL177C 513 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 EPS1YIL005W 2106 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 ODC2YOR222W 924 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 OSM1YJR051W 1506 nt5.58□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YFL052WYFL052W 1398 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 THI2YBR240C 1353 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YCR049CYCR049C 447 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 MDH3YDL078C 1032 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YIL168WYIL168W 384 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 MRS1YIR021W 1092 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 SEN2YLR105C 1134 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YLR123CYLR123C 330 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 FCY1YPR062W 477 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 RIM101YHL027W 1878 nt5.57□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 RIX7YLL034C 2514 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 BUD9YGR041W 1644 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 DMC1YER179W 1005 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 STS1YIR011C 960 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YJL193WYJL193W 1209 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 DPM1YPR183W 804 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YPL277CYPL277C 1464 nt5.56□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 SQT1YIR012W 1296 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YLR162WYLR162W 357 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YML079WYML079W 606 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 PAU19YMR325W 375 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 SCO2YBR024W 906 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 ERV2YPR037C 591 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 ECM3YOR092W 1842 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 CMR1YDL156W 1569 nt5.55□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YAP1801YHR161C 1914 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 PGM1YKL127W 1713 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 CCC2YDR270W 3015 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 NFS1YCL017C 1494 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YJL160CYJL160C 864 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YML083CYML083C 1257 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 BSC4YNL269W 396 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 CLB1YGR108W 1416 nt5.54□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 SPR1YOR190W 1338 nt5.53□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 YLR312CYLR312C 1197 nt5.53□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 SNU71YGR013W 1863 nt5.53□□□□□ -1.52
SNU23Q12368 TRP3YKL211C 1455 nt5.52□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 YSC83YHR017W 1158 nt5.52□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 CBR1YIL043C 855 nt5.52□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 CHS5YLR330W 2016 nt5.52□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 YMR034CYMR034C 1305 nt5.51□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 AGX1YFL030W 1158 nt5.51□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 VTC2YFL004W 2487 nt5.51□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 TAX4YJL083W 1815 nt5.51□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 EDE1YBL047C 4146 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 CLP1YOR250C 1338 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 UTR5YEL035C 501 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 PIL1YGR086C 1020 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 MFT1YML062C 1179 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 POR1YNL055C 852 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 ISN1YOR155C 1353 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 UBA1YKL210W 3075 nt5.5□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 NTE1YML059C 5040 nt5.49□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 MSY1YPL097W 1479 nt5.49□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 GAA1YLR088W 1845 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 VPS1YKR001C 2115 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 HRB1YNL004W 1365 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 YCP4YCR004C 744 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 TRP1YDR007W 675 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 MIA40YKL195W 1212 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 SWD1YAR003W 1281 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 YMR007WYMR007W 381 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 RKI1YOR095C 777 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 SUE1YPR151C 621 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 PNS1YOR161C 1620 nt5.48□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 IMA2YOL157C 1770 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 TBF1YPL128C 1689 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 YLL067CYLL067C 3618 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 PGK1YCR012W 1251 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 YDR278CYDR278C 318 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 COA1YIL157C 594 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 PAM17YKR065C 594 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 CPT1YNL130C 1182 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 ERC1YHR032W 1746 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 TEP1YNL128W 1305 nt5.47□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 SSK22YCR073C 3996 nt5.46□□□□□ -1.53
SNU23Q12368 HEM2YGL040C 1029 nt5.46□□□□□ -1.54
SNU23Q12368 PHO86YJL117W 936 nt5.46□□□□□ -1.54
SNU23Q12368 COQ3YOL096C 939 nt5.46□□□□□ -1.54
SNU23Q12368 CNE1YAL058W 1509 nt5.46□□□□□ -1.54
SNU23Q12368 RGT1YKL038W 3513 nt5.46□□□□□ -1.54
SNU23Q12368 YGR054WYGR054W 1929 nt5.46□□□□□ -1.54
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