Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IFFO1Q0D2I5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFFO1Q0D2I5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IFFO1Q0D2I5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFFO1Q0D2I5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms