Protein–RNA interactions for Protein: Q08723

RPN8, 26S proteasome regulatory subunit RPN8, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN8Q08723 AIM3YBR108W 2844 nt6.49□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 ERP2YAL007C 648 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 COX5AYNL052W 462 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 ADH5YBR145W 1056 nt6.48□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YJR107WYJR107W 987 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 TSR2YLR435W 618 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 TMA46YOR091W 1038 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 IMA5YJL216C 1746 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 YHR131CYHR131C 2553 nt6.47□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 SES1YDR023W 1389 nt6.46□□□□□ -1.37
RPN8Q08723 VMA3YEL027W 483 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 CUP2YGL166W 678 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YML018CYML018C 1182 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 SPG5YMR191W 1122 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 COQ3YOL096C 939 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YMR034CYMR034C 1305 nt6.46□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YHK8YHR048W 1545 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 MRPS28YDR337W 861 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 TOS6YNL300W 309 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 UIP5YKR044W 1332 nt6.45□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 REC107YJR021C 945 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 GCN3YKR026C 918 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 ATG22YCL038C 1587 nt6.44□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 TPO3YPR156C 1869 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YDR187CYDR187C 519 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YKL102CYKL102C 306 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 MRPL10YNL284C 969 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 ZWF1YNL241C 1518 nt6.43□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 MED6YHR058C 888 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 ICS3YJL077C 396 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 MET8YBR213W 825 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 TAE1YBR261C 699 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 HAL5YJL165C 2568 nt6.42□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 UBP13YBL067C 2244 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 PPM1YDR435C 987 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 IRC7YFR055W 1023 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 MSP1YGR028W 1089 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YRB2YIL063C 984 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YMR295CYMR295C 594 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YNL097W-AYNL097W-A 156 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 GPD2YOL059W 1323 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 POP1YNL221C 2628 nt6.41□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 PMT3YOR321W 2262 nt6.4□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 snR82snR82 268 nt6.4□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.4□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 HGH1YGR187C 1185 nt6.4□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 YML6YML025C 861 nt6.4□□□□□ -1.38
RPN8Q08723 RMD9YGL107C 1941 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 FRE5YOR384W 2085 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 TIM22YDL217C 624 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YKL077WYKL077W 1179 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YKR032WYKR032W 315 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YAR064WYAR064W 300 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 DUS4YLR405W 1104 nt6.39□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 URH1YDR400W 1023 nt6.38□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YKR045CYKR045C 552 nt6.38□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 HEM1YDR232W 1647 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 KTR5YNL029C 1569 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 GYP8YFL027C 1494 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 PEX3YDR329C 1326 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YDR415CYDR415C 1125 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 IRC11YOR013W 471 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 ESC8YOL017W 2145 nt6.37□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 SLX5YDL013W 1860 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 FET4YMR319C 1659 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YLL067CYLL067C 3618 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 RSA4YCR072C 1548 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 COX10YPL172C 1389 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 PRE3YJL001W 648 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 PFK2YMR205C 2880 nt6.36□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 STB5YHR178W 2232 nt6.35□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 HED1YDR014W-A 489 nt6.35□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 YGR127WYGR127W 939 nt6.35□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 CRP1YHR146W 1398 nt6.34□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 NMT1YLR195C 1368 nt6.34□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 CBR1YIL043C 855 nt6.34□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 RPS28AYOR167C 204 nt6.34□□□□□ -1.39
RPN8Q08723 VHT1YGR065C 1782 nt6.34□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 UTR2YEL040W 1404 nt6.33□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 HEM2YGL040C 1029 nt6.33□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 SEC62YPL094C 825 nt6.33□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YPT1YFL038C 621 nt6.32□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 MRPL23YOR150W 492 nt6.32□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 CTF19YPL018W 1110 nt6.32□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YDR514CYDR514C 1452 nt6.31□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 OAC1YKL120W 975 nt6.31□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 ZRT2YLR130C 1269 nt6.31□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 RPL31BYLR406C 342 nt6.31□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 YDL177CYDL177C 513 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)BtG(GCC)B 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 SUF16tG(GCC)C 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)D1tG(GCC)D1 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)D2tG(GCC)D2 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)EtG(GCC)E 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 SUF20tG(GCC)F1 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)F2tG(GCC)F2 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.3□□□□□ -1.4
RPN8Q08723 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.3□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.1 ms