Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 tG(GCC)G1tG(GCC)G1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)G2tG(GCC)G2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)J1tG(GCC)J1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 SUF23tG(GCC)J2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)MtG(GCC)M 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)O1tG(GCC)O1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 SUF17tG(GCC)O2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)P1tG(GCC)P1 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 tG(GCC)P2tG(GCC)P2 71 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 ATG36YJL185C 882 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YLL056CYLL056C 897 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YLR162WYLR162W 357 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 MRPL19YNL185C 477 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 PRE2YPR103W 864 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 JIP4YDR475C 2631 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 RSP5YER125W 2430 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 OPT1YJL212C 2400 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 GPA1YHR005C 1419 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 CDS1YBR029C 1374 nt6.82□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 MMS21YEL019C 804 nt6.81□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 MIA40YKL195W 1212 nt6.81□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 SWD1YAR003W 1281 nt6.81□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YBR113WYBR113W 483 nt6.81□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YDR401WYDR401W 564 nt6.8□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YPT1YFL038C 621 nt6.8□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.8□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 TAF11YML015C 1041 nt6.8□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 ICP55YER078C 1536 nt6.8□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 CDC10YCR002C 969 nt6.79□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 GTT3YEL017W 1014 nt6.79□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 FZF1YGL254W 900 nt6.79□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 YBL081WYBL081W 1107 nt6.79□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 DFR1YOR236W 636 nt6.79□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 HEM1YDR232W 1647 nt6.79□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 GAA1YLR088W 1845 nt6.78□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 FPR2YDR519W 408 nt6.78□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 PUP2YGR253C 783 nt6.78□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 FIT2YOR382W 462 nt6.78□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 STT3YGL022W 2157 nt6.78□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 EDE1YBL047C 4146 nt6.78□□□□□ -1.32
VHS3Q08438 PMT3YOR321W 2262 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 TRP1YDR007W 675 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 HED1YDR014W-A 489 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 QCR6YFR033C 444 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 SES1YDR023W 1389 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 DAL4YIR028W 1908 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 ATF1YOR377W 1578 nt6.77□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 COQ1YBR003W 1422 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YIR017W-AYIR017W-A 600 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 CYS3YAL012W 1185 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 MRPL24YMR193W 777 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 COX5AYNL052W 462 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YNR048WYNR048W 1182 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 SEC62YPL094C 825 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YJL163CYJL163C 1668 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 MSC3YLR219W 2187 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YIL092WYIL092W 1902 nt6.76□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 COX10YPL172C 1389 nt6.75□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 AIM41YOR215C 558 nt6.75□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 NUP49YGL172W 1419 nt6.75□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 PHO3YBR092C 1404 nt6.75□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YPR204WYPR204W 3099 nt6.75□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 MFG1YDL233W 1377 nt6.74□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 RFC4YOL094C 972 nt6.74□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 MPA43YNL249C 1629 nt6.74□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 FBA1YKL060C 1080 nt6.73□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 SML1YML058W 315 nt6.73□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 KSH1YNL024C-A 219 nt6.73□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YPR076WYPR076W 375 nt6.73□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 LAT1YNL071W 1449 nt6.73□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 MKK1YOR231W 1527 nt6.72□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 AIM33YML087C 939 nt6.72□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YPL250W-AYPL250W-A 288 nt6.72□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 DRS1YLL008W 2259 nt6.71□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 THI2YBR240C 1353 nt6.71□□□□□ -1.33
VHS3Q08438 YER147C-AYER147C-A 411 nt6.71□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 ERP5YHR110W 639 nt6.71□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 GLN3YER040W 2193 nt6.71□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 IES1YFL013C 2079 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 RPP1YHR062C 882 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 YOX1YML027W 1158 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 NOG2YNR053C 1461 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 FET4YMR319C 1659 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 DPB2YPR175W 2070 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 PEX3YDR329C 1326 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 DOT1YDR440W 1749 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 SKI2YLR398C 3864 nt6.7□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 PAP2YOL115W 1755 nt6.69□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 PCL10YGL134W 1302 nt6.69□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 TKL2YBR117C 2046 nt6.69□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 RSC2YLR357W 2670 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 GAT1YFL021W 1533 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 AIM46YHR199C 933 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 SQT1YIR012W 1296 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 YJR146WYJR146W 354 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 YNL120CYNL120C 486 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 YOL046CYOL046C 675 nt6.68□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 UTR2YEL040W 1404 nt6.67□□□□□ -1.34
VHS3Q08438 YHK8YHR048W 1545 nt6.67□□□□□ -1.34
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