Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 UME1YPL139C 1383 nt5.97□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 QCR8YJL166W 285 nt5.97□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 PRY3YJL078C 2646 nt5.96□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 CYC8YBR112C 2901 nt5.96□□□□□ -1.45
NEJ1Q06148 DID2YKR035W-A 615 nt5.96□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 MBF1YOR298C-A 456 nt5.96□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 HXT15YDL245C 1704 nt5.96□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 HXT16YJR158W 1704 nt5.96□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 KEL1YHR158C 3495 nt5.95□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 FAL1YDR021W 1200 nt5.95□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 KAE1YKR038C 1161 nt5.95□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YLR162WYLR162W 357 nt5.95□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YBL070CYBL070C 321 nt5.95□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 CST26YBR042C 1194 nt5.95□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 CSC1YLR241W 2349 nt5.94□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 MKK1YOR231W 1527 nt5.94□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 CBK1YNL161W 2271 nt5.94□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 IES2YNL215W 963 nt5.94□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 FIT2YOR382W 462 nt5.94□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YHK8YHR048W 1545 nt5.94□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 RPS28AYOR167C 204 nt5.93□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 LDB16YCL005W 771 nt5.93□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 HXK2YGL253W 1461 nt5.93□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 ACS1YAL054C 2142 nt5.93□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 POP1YNL221C 2628 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 COA1YIL157C 594 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 MDE1YJR024C 735 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 RUF23RUF23 254 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YPR123CYPR123C 435 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 RSA4YCR072C 1548 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 PYK2YOR347C 1521 nt5.92□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 AFG1YEL052W 1530 nt5.91□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YDL085C-AYDL085C-A 207 nt5.91□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YDR278CYDR278C 318 nt5.91□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 LCB3YJL134W 1230 nt5.91□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 KTR1YOR099W 1182 nt5.91□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YJL163CYJL163C 1668 nt5.91□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 STB5YHR178W 2232 nt5.9□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YHL017WYHL017W 1599 nt5.9□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 YRB2YIL063C 984 nt5.9□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 MRS1YIR021W 1092 nt5.9□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 RPL21AYBR191W 483 nt5.9□□□□□ -1.46
NEJ1Q06148 PRP24YMR268C 1335 nt5.9□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 PDR18YNR070W 4002 nt5.9□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 MPA43YNL249C 1629 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 snR82snR82 268 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YGR127WYGR127W 939 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 LYS1YIR034C 1122 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YKL077WYKL077W 1179 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 MRPL23YOR150W 492 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 ESC8YOL017W 2145 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 KTR5YNL029C 1569 nt5.89□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 RMD9YGL107C 1941 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 THI4YGR144W 981 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 CYS3YAL012W 1185 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 POP5YAL033W 522 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YML079WYML079W 606 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 RNH1YMR234W 1047 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 EFT2YDR385W 2529 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 EFT1YOR133W 2529 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 HAS1YMR290C 1518 nt5.88□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 LAG2YOL025W 1983 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 VPS5YOR069W 2028 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YAR064WYAR064W 300 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YPR076WYPR076W 375 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 MFG1YDL233W 1377 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 PXL1YKR090W 2121 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YOL036WYOL036W 2286 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 MRC1YCL061C 3291 nt5.87□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 PGK1YCR012W 1251 nt5.86□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 EFM3YJR129C 1020 nt5.86□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YML083CYML083C 1257 nt5.86□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 HRQ1YDR291W 3234 nt5.86□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YGR054WYGR054W 1929 nt5.86□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YDR387CYDR387C 1668 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 HIS7YBR248C 1659 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 ALT2YDR111C 1524 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 RBS1YDL189W 1374 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YIR042CYIR042C 711 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 MEH1YKR007W 555 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YOR268CYOR268C 399 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 ECM31YBR176W 939 nt5.85□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 CLB2YPR119W 1476 nt5.84□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 VPS4YPR173C 1314 nt5.84□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 AGX1YFL030W 1158 nt5.84□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YGL235WYGL235W 537 nt5.84□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 YOL163WYOL163W 510 nt5.84□□□□□ -1.47
NEJ1Q06148 LDB19YOR322C 2457 nt5.84□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 IVY1YDR229W 1362 nt5.83□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 ARE2YNR019W 1929 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 PUP2YGR253C 783 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 CCP1YKR066C 1086 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 PRE5YMR314W 705 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 ASR1YPR093C 867 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 MTC5YDR128W 3447 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 MNN5YJL186W 1761 nt5.82□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 ATG22YCL038C 1587 nt5.81□□□□□ -1.48
NEJ1Q06148 PPH21YDL134C 1110 nt5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms