Protein–RNA interactions for Protein: Q03654

CEF1, Pre-mRNA-splicing factor CEF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CEF1Q03654 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YJU2YKL095W 837 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 CBT1YKL208W 816 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SWD1YAR003W 1281 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 RPL31BYLR406C 342 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YOR012WYOR012W 414 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 PET112YBL080C 1626 nt7.18□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 AMN1YBR158W 1650 nt7.17□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 GPD1YDL022W 1176 nt7.17□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 LCL3YGL085W 825 nt7.17□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 YSC83YHR017W 1158 nt7.17□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SKY1YMR216C 2229 nt7.17□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 GPH1YPR160W 2709 nt7.17□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 NOP7YGR103W 1818 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SRP101YDR292C 1866 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SNF4YGL115W 969 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SEC62YPL094C 825 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 SNT309YPR101W 528 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 AIM17YHL021C 1398 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 PAC2YER007W 1557 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 VMA2YBR127C 1554 nt7.16□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 CEM1YER061C 1329 nt7.15□□□□□ -1.26
CEF1Q03654 HIS7YBR248C 1659 nt7.15□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 BNA3YJL060W 1335 nt7.14□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MRPL19YNL185C 477 nt7.14□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 DOT1YDR440W 1749 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 CCT3YJL014W 1605 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 HXK2YGL253W 1461 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 SAL1YNL083W 1485 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MCH2YKL221W 1422 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YMR034CYMR034C 1305 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 AIM20YIL158W 615 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 SIT1YEL065W 1887 nt7.13□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 HXT2YMR011W 1626 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 TRP5YGL026C 2124 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 BPL1YDL141W 2073 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 PAC10YGR078C 600 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YKL153WYKL153W 510 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 TMA46YOR091W 1038 nt7.12□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 TUF1YOR187W 1314 nt7.11□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YGL072CYGL072C 360 nt7.11□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 CBR1YIL043C 855 nt7.11□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 RNH1YMR234W 1047 nt7.11□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 TAF9YMR236W 474 nt7.11□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MRPS18YNL306W 654 nt7.11□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 GCG1YER163C 699 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 SRY1YKL218C 981 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MEU1YLR017W 1014 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 IRC11YOR013W 471 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MRPL23YOR150W 492 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 RFS1YBR052C 633 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 TKL2YBR117C 2046 nt7.1□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 TAH11YJR046W 1815 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YDL177CYDL177C 513 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MRPL35YDR322W 1104 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 MRPL28YDR462W 444 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 SOH1YGL127C 384 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 SCS22YBL091C-A 528 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 YBL112CYBL112C 318 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 HBN1YCL026C-B 582 nt7.09□□□□□ -1.27
CEF1Q03654 COQ1YBR003W 1422 nt7.09□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ERG8YMR220W 1356 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 SNF11YDR073W 510 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 MTR3YGR158C 753 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 AIM2YAL049C 741 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 TSR2YLR435W 618 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ECM2YBR065C 1095 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 YHR020WYHR020W 2067 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 IMA2YOL157C 1770 nt7.08□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ECM7YLR443W 1347 nt7.07□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 VMS1YDR049W 1899 nt7.07□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 RSP5YER125W 2430 nt7.07□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 YKL102CYKL102C 306 nt7.07□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ILV6YCL009C 930 nt7.07□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 SEC18YBR080C 2277 nt7.07□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ATG18YFR021W 1503 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 DDC1YPL194W 1839 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 POP1YNL221C 2628 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 RGD2YFL047W 2145 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 OPI7YDR360W 435 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 HHY1YEL059W 309 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 YHR140WYHR140W 720 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 OM45YIL136W 1182 nt7.06□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 GSH1YJL101C 2037 nt7.05□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 TRP1YDR007W 675 nt7.05□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 HED1YDR014W-A 489 nt7.05□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 YMR252CYMR252C 405 nt7.05□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 YMR155WYMR155W 1644 nt7.05□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ASN1YPR145W 1719 nt7.04□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 CDC10YCR002C 969 nt7.04□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ARC35YNR035C 1029 nt7.04□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 STT3YGL022W 2157 nt7.03□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ERS1YCR075C 783 nt7.03□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 DID2YKR035W-A 615 nt7.03□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 MHT1YLL062C 975 nt7.03□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt7.03□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 CUE4YML101C 354 nt7.03□□□□□ -1.28
CEF1Q03654 ADH5YBR145W 1056 nt7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 16.4 ms