Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDK16Q00536 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDK16Q00536 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CDK16Q00536 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDK16Q00536 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms