Protein–RNA interactions for Protein: P68104

EEF1A1, Elongation factor 1-alpha 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEF1A1P68104 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EEF1A1P68104 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
EEF1A1P68104 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EEF1A1P68104 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EEF1A1P68104 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms