Protein–RNA interactions for Protein: P61073

CXCR4, C-X-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR4P61073 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR4P61073 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CXCR4P61073 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CXCR4P61073 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms