Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SH3BGRP55822 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SH3BGRP55822 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SH3BGRP55822 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SH3BGRP55822 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms