Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHBP55084 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHBP55084 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHBP55084 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HADHBP55084 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHBP55084 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHBP55084 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHBP55084 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HADHBP55084 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHBP55084 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHBP55084 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HADHBP55084 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HADHBP55084 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HADHBP55084 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HADHBP55084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HADHBP55084 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HADHBP55084 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HADHBP55084 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HADHBP55084 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HADHBP55084 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HADHBP55084 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HADHBP55084 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HADHBP55084 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HADHBP55084 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HADHBP55084 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HADHBP55084 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HADHBP55084 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HADHBP55084 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HADHBP55084 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HADHBP55084 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HADHBP55084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HADHBP55084 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HADHBP55084 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HADHBP55084 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HADHBP55084 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HADHBP55084 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HADHBP55084 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
HADHBP55084 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
HADHBP55084 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HADHBP55084 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HADHBP55084 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HADHBP55084 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HADHBP55084 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HADHBP55084 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HADHBP55084 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HADHBP55084 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HADHBP55084 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HADHBP55084 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HADHBP55084 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
HADHBP55084 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
HADHBP55084 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HADHBP55084 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HADHBP55084 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HADHBP55084 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HADHBP55084 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HADHBP55084 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms