Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SRP9P49458 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP9P49458 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP9P49458 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SRP9P49458 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SRP9P49458 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SRP9P49458 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SRP9P49458 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP9P49458 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP9P49458 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP9P49458 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP9P49458 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SRP9P49458 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP9P49458 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP9P49458 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP9P49458 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SRP9P49458 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP9P49458 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP9P49458 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SRP9P49458 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP9P49458 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP9P49458 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP9P49458 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SRP9P49458 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SRP9P49458 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP9P49458 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP9P49458 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP9P49458 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP9P49458 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SRP9P49458 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRP9P49458 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRP9P49458 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SRP9P49458 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SRP9P49458 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SRP9P49458 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRP9P49458 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRP9P49458 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SRP9P49458 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SRP9P49458 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SRP9P49458 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP9P49458 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP9P49458 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP9P49458 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SRP9P49458 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRP9P49458 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRP9P49458 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SRP9P49458 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SRP9P49458 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SRP9P49458 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.28■■□□□ 1
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