Protein–RNA interactions for Protein: P40489

XBP1, Transcriptional repressor XBP1, yeastyeast

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Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
XBP1P40489 YER147C-AYER147C-A 411 nt5.87□□□□□ -1.47
XBP1P40489 REC107YJR021C 945 nt5.87□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YKL018C-AYKL018C-A 300 nt5.87□□□□□ -1.47
XBP1P40489 DPH5YLR172C 903 nt5.87□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YNR014WYNR014W 639 nt5.87□□□□□ -1.47
XBP1P40489 NDJ1YOL104C 1059 nt5.87□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YPL277CYPL277C 1464 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 AI3Q0060 1248 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 RRP1YDR087C 837 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 BIM1YER016W 1035 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 CTF8YHR191C 402 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 QRI5YLR204W 336 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YMR122CYMR122C 375 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 OSW2YLR054C 2175 nt5.86□□□□□ -1.47
XBP1P40489 GAT1YFL021W 1533 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 MRPS28YDR337W 861 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 SUA5YGL169W 1281 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 SPG5YMR191W 1122 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 RPL5YPL131W 894 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 GPH1YPR160W 2709 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 AGP2YBR132C 1791 nt5.85□□□□□ -1.47
XBP1P40489 PAC2YER007W 1557 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 RGD2YFL047W 2145 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 ECM38YLR299W 1983 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 HSP12YFL014W 330 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 COS6YGR295C 1146 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YHR145CYHR145C 357 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YKL102CYKL102C 306 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 AVO2YMR068W 1281 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 RRP9YPR137W 1722 nt5.84□□□□□ -1.47
XBP1P40489 YMR034CYMR034C 1305 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 PPH22YDL188C 1134 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 OPI8YKR035C 642 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 SUR7YML052W 909 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 CUE4YML101C 354 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 SCS7YMR272C 1155 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 RNH201YNL072W 924 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YNL092WYNL092W 1203 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 TMA46YOR091W 1038 nt5.83□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 TDH2YJR009C 999 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YLR463CYLR463C 552 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 DSE3YOR264W 1293 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 MRI1YPR118W 1236 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 CTR1YPR124W 1221 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 CDC1YDR182W 1476 nt5.82□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YHK8YHR048W 1545 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YFL013W-AYFL013W-A 804 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 DYS1YHR068W 1164 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 MHT1YLL062C 975 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 TSR2YLR435W 618 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YBR027CYBR027C 333 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 ADH5YBR145W 1056 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 SGE1YPR198W 1632 nt5.81□□□□□ -1.48
XBP1P40489 PEX31YGR004W 1389 nt5.8□□□□□ -1.48
XBP1P40489 ARP3YJR065C 1350 nt5.8□□□□□ -1.48
XBP1P40489 EHD3YDR036C 1503 nt5.8□□□□□ -1.48
XBP1P40489 BDF2YDL070W 1917 nt5.8□□□□□ -1.48
XBP1P40489 FSF1YOR271C 984 nt5.8□□□□□ -1.48
XBP1P40489 PRE2YPR103W 864 nt5.8□□□□□ -1.48
XBP1P40489 HED1YDR014W-A 489 nt5.79□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YRB2YIL063C 984 nt5.79□□□□□ -1.48
XBP1P40489 LYS12YIL094C 1116 nt5.79□□□□□ -1.48
XBP1P40489 VTS1YOR359W 1572 nt5.79□□□□□ -1.48
XBP1P40489 UIP5YKR044W 1332 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 CLN1YMR199W 1641 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YJR107WYJR107W 987 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YKL077WYKL077W 1179 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 GCN3YKR026C 918 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YLR036CYLR036C 612 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 RPL31BYLR406C 342 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 SEC62YPL094C 825 nt5.78□□□□□ -1.48
XBP1P40489 YDR187CYDR187C 519 nt5.77□□□□□ -1.49
XBP1P40489 VMA3YEL027W 483 nt5.77□□□□□ -1.49
XBP1P40489 CUP2YGL166W 678 nt5.77□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YHR213W-BYHR213W-B 300 nt5.77□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YAR064WYAR064W 300 nt5.77□□□□□ -1.49
XBP1P40489 ZWF1YNL241C 1518 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 CBR1YIL043C 855 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YKR045CYKR045C 552 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YML018CYML018C 1182 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YMR114CYMR114C 1107 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 TAE1YBR261C 699 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 NTE1YML059C 5040 nt5.76□□□□□ -1.49
XBP1P40489 EMP65YER140W 1671 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 MAK32YCR019W 1092 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YDL177CYDL177C 513 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 FPR2YDR519W 408 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 GTT3YEL017W 1014 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 PEX12YMR026C 1200 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 MRPL24YMR193W 777 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 DAL4YIR028W 1908 nt5.75□□□□□ -1.49
XBP1P40489 TRS31YDR472W 852 nt5.74□□□□□ -1.49
XBP1P40489 RAI1YGL246C 1164 nt5.74□□□□□ -1.49
XBP1P40489 SED5YLR026C 1023 nt5.74□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YLR157W-EYLR157W-E 165 nt5.74□□□□□ -1.49
XBP1P40489 YLR311CYLR311C 348 nt5.74□□□□□ -1.49
XBP1P40489 MRPL23YOR150W 492 nt5.74□□□□□ -1.49
XBP1P40489 COX10YPL172C 1389 nt5.74□□□□□ -1.49
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