Protein–RNA interactions for Protein: P39548

YAR028W, DUP240 protein YAR028W, yeastyeast

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YAR028WP39548 AFG3YER017C 2286 nt6.96□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YDR222WYDR222W 1248 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 DUO1YGL061C 744 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YGL101WYGL101W 648 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 LOT6YLR011W 576 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 CTL1YMR180C 963 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 LIP5YOR196C 1245 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 HAT1YPL001W 1125 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 GPI2YPL076W 843 nt6.95□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 BAP3YDR046C 1815 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 FCY2YER056C 1602 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 PAP1YKR002W 1707 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YIL086CYIL086C 309 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YIL168WYIL168W 384 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 MFT1YML062C 1179 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 NCE103YNL036W 666 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 HST2YPL015C 1074 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 HAL1YPR005C 885 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 DRS1YLL008W 2259 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 ERG24YNL280C 1317 nt6.94□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 RRP43YCR035C 1185 nt6.93□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 SAY1YGR263C 1275 nt6.93□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 DAP1YPL170W 459 nt6.93□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 NFI1YOR156C 2181 nt6.93□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 BDS1YOL164W 1941 nt6.92□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 MRP1YDR347W 966 nt6.92□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 UTR5YEL035C 501 nt6.92□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 ERP2YAL007C 648 nt6.92□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 CSG2YBR036C 1233 nt6.92□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 AAD6YFL056C 639 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 ARI1YGL157W 1044 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 RRT7YLL030C 342 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 GLC8YMR311C 690 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 SSU72YNL222W 621 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 HRT1YOL133W 366 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YOR169CYOR169C 465 nt6.91□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 AFG2YLR397C 2343 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YCP4YCR004C 744 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YCR041WYCR041W 333 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 WSS1YHR134W 810 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YMR007WYMR007W 381 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 JNM1YMR294W 1122 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YNL226WYNL226W 411 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 ODC2YOR222W 924 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 PTC4YBR125C 1182 nt6.9□□□□□ -1.3
YAR028WP39548 YEF1YEL041W 1488 nt6.9□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 DHH1YDL160C 1521 nt6.9□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YEL023CYEL023C 2049 nt6.89□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 SNF4YGL115W 969 nt6.89□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 IES1YFL013C 2079 nt6.89□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 PPZ2YDR436W 2133 nt6.89□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YIL108WYIL108W 2091 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 MSS116YDR194C 1995 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 RCK1YGL158W 1539 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YCR016WYCR016W 873 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YEL028WYEL028W 462 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 HVG1YER039C 750 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 Q0142Q0142 177 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YLF2YHL014C 1218 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YLR402WYLR402W 192 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YOR012WYOR012W 414 nt6.88□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 TAH18YPR048W 1872 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 EXG2YDR261C 1689 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 ERG12YMR208W 1332 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YDR336WYDR336W 945 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 HCR1YLR192C 798 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 BLS1YLR408C 369 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 GTR1YML121W 933 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 VPS68YOL129W 555 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 IRC11YOR013W 471 nt6.87□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 SPS1YDR523C 1473 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 MDM10YAL010C 1482 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 GRX6YDL010W 696 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YLR112WYLR112W 420 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YPT10YBR264C 600 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 POX1YGL205W 2247 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 CDC3YLR314C 1563 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YBL111CYBL111C 2004 nt6.86□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 PMT2YAL023C 2280 nt6.85□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 NDE1YMR145C 1683 nt6.85□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 PSA1YDL055C 1086 nt6.85□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 PAC10YGR078C 600 nt6.85□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 DCG1YIR030C 735 nt6.85□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 YPL136WYPL136W 369 nt6.85□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 OMS1YDR316W 1416 nt6.84□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 PPS1YBR276C 2424 nt6.84□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 RRS1YOR294W 612 nt6.84□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 ATG18YFR021W 1503 nt6.84□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 PSP2YML017W 1782 nt6.84□□□□□ -1.31
YAR028WP39548 NUP84YDL116W 2181 nt6.84□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 SRF1YDL133W 1314 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 MRPL6YHR147C 645 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 MPM1YJL066C 759 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 YLL047WYLL047W 384 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 RCR1YBR005W 642 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 DSC3YOR223W 879 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 TFB6YOR352W 1032 nt6.83□□□□□ -1.32
YAR028WP39548 LPL1YOR059C 1353 nt6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.9 ms