Protein–RNA interactions for Protein: P38339

RGD1, RHO GTPase-activating protein RGD1, yeastyeast

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RGD1P38339 DPB2YPR175W 2070 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 ENP1YBR247C 1452 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 ARO10YDR380W 1908 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 ARP3YJR065C 1350 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YLR283WYLR283W 945 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YET2YMR040W 483 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 PHA2YNL316C 1005 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YPL136WYPL136W 369 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 ARR1YPR199C 885 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YCL049CYCL049C 939 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 WHI4YDL224C 1950 nt7.37□□□□□ -1.23
RGD1P38339 APM4YOL062C 1476 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 CIA1YDR267C 993 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 HPT1YDR399W 666 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 FPR2YDR519W 408 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 SPG1YGR236C 288 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 UBC12YLR306W 567 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 HTZ1YOL012C 405 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 RPL5YPL131W 894 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 POS5YPL188W 1245 nt7.36□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YAL016C-BYAL016C-B 186 nt7.35□□□□□ -1.23
RGD1P38339 SUR7YML052W 909 nt7.35□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YOL099CYOL099C 492 nt7.35□□□□□ -1.23
RGD1P38339 FIT2YOR382W 462 nt7.35□□□□□ -1.23
RGD1P38339 PPH21YDL134C 1110 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YJR056CYJR056C 711 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 YKR075CYKR075C 924 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 RDN5-2RDN5-2 119 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 RDN5-3RDN5-3 119 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 RDN5-4RDN5-4 119 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 RDN5-5RDN5-5 119 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 NMD4YLR363C 657 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 ALG5YPL227C 1005 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 RPL43AYPR043W 279 nt7.34□□□□□ -1.23
RGD1P38339 PPH22YDL188C 1134 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 MAF1YDR005C 1188 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YDR401WYDR401W 564 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 DYS1YHR068W 1164 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YOR300WYOR300W 309 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 MUM3YOR298W 1440 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PLB2YMR006C 2121 nt7.33□□□□□ -1.24
RGD1P38339 TUF1YOR187W 1314 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 BUD9YGR041W 1644 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PMP3YDR276C 168 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 EAF5YEL018W 840 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 GAL83YER027C 1254 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 AIM20YIL158W 615 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 ADD66YKL206C 804 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 AME1YBR211C 975 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PRP40YKL012W 1752 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 SAS4YDR181C 1446 nt7.32□□□□□ -1.24
RGD1P38339 MIP1YOR330C 3765 nt7.31□□□□□ -1.24
RGD1P38339 CDC16YKL022C 2523 nt7.31□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YCR006CYCR006C 474 nt7.31□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PAC2YER007W 1557 nt7.31□□□□□ -1.24
RGD1P38339 ARC19YKL013C 516 nt7.31□□□□□ -1.24
RGD1P38339 APE4YHR113W 1473 nt7.3□□□□□ -1.24
RGD1P38339 OPI7YDR360W 435 nt7.3□□□□□ -1.24
RGD1P38339 MTQ1YNL063W 945 nt7.3□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YNL194CYNL194C 906 nt7.3□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PEX31YGR004W 1389 nt7.3□□□□□ -1.24
RGD1P38339 MRPL35YDR322W 1104 nt7.29□□□□□ -1.24
RGD1P38339 AGX1YFL030W 1158 nt7.29□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YGR291CYGR291C 222 nt7.29□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PEX22YAL055W 543 nt7.29□□□□□ -1.24
RGD1P38339 ASR1YPR093C 867 nt7.29□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt7.29□□□□□ -1.24
RGD1P38339 PHO3YBR092C 1404 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YPR204WYPR204W 3099 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 ARG81YML099C 2643 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 SHO1YER118C 1104 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 GFD1YMR255W 567 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 YNR005CYNR005C 405 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 TSR3YOR006C 942 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 CLB4YLR210W 1383 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 VMA2YBR127C 1554 nt7.28□□□□□ -1.24
RGD1P38339 TRS31YDR472W 852 nt7.27□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YHC3YJL059W 1227 nt7.27□□□□□ -1.25
RGD1P38339 CBT1YKL208W 816 nt7.27□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YLR184WYLR184W 348 nt7.27□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YCR061WYCR061W 1896 nt7.27□□□□□ -1.25
RGD1P38339 snR57snR57 88 nt7.26□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YGR066CYGR066C 879 nt7.26□□□□□ -1.25
RGD1P38339 PEX34YCL056C 435 nt7.26□□□□□ -1.25
RGD1P38339 AVT4YNL101W 2142 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 RKM4YDR257C 1485 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 MED2YDL005C 1296 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YDL157CYDL157C 357 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 COX3Q0275 810 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YNL017CYNL017C 339 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 BRN1YBL097W 2265 nt7.25□□□□□ -1.25
RGD1P38339 GLE1YDL207W 1617 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 IMG1YCR046C 510 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 GTT3YEL017W 1014 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 RRP46YGR095C 672 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 SPO12YHR152W 522 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 YBR226CYBR226C 411 nt7.24□□□□□ -1.25
RGD1P38339 HER2YMR293C 1395 nt7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.6 ms