Protein–RNA interactions for Protein: P29373

CRABP2, Cellular retinoic acid-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP2P29373 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CRABP2P29373 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CRABP2P29373 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CRABP2P29373 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CRABP2P29373 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CRABP2P29373 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms