Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
HRCP23327 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
HRCP23327 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HRCP23327 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
HRCP23327 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
HRCP23327 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HRCP23327 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HRCP23327 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
HRCP23327 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
HRCP23327 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HRCP23327 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
HRCP23327 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
HRCP23327 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
HRCP23327 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
HRCP23327 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HRCP23327 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC37.68■■■■□ 3.62
HRCP23327 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
HRCP23327 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
HRCP23327 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
HRCP23327 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HRCP23327 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HRCP23327 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
HRCP23327 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
HRCP23327 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
HRCP23327 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
HRCP23327 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HRCP23327 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HRCP23327 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
HRCP23327 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
HRCP23327 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HRCP23327 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HRCP23327 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
HRCP23327 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HRCP23327 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
HRCP23327 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
HRCP23327 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
HRCP23327 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
HRCP23327 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HRCP23327 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
HRCP23327 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
HRCP23327 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HRCP23327 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HRCP23327 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
HRCP23327 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
HRCP23327 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HRCP23327 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
HRCP23327 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
HRCP23327 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HRCP23327 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
HRCP23327 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HRCP23327 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
HRCP23327 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
HRCP23327 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HRCP23327 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
HRCP23327 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
HRCP23327 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
HRCP23327 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HRCP23327 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HRCP23327 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
HRCP23327 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
HRCP23327 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
HRCP23327 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HRCP23327 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HRCP23327 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HRCP23327 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HRCP23327 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
HRCP23327 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
HRCP23327 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
HRCP23327 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
HRCP23327 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
HRCP23327 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
HRCP23327 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
HRCP23327 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
HRCP23327 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
HRCP23327 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HRCP23327 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HRCP23327 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
HRCP23327 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HRCP23327 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
HRCP23327 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HRCP23327 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
HRCP23327 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HRCP23327 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HRCP23327 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
HRCP23327 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms