Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NR2F1P10589 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NR2F1P10589 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NR2F1P10589 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NR2F1P10589 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms