Protein–RNA interactions for Protein: P10398

ARAF, Serine/threonine-protein kinase A-Raf, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAFP10398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARAFP10398 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARAFP10398 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ARAFP10398 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ARAFP10398 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARAFP10398 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARAFP10398 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARAFP10398 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARAFP10398 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARAFP10398 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ARAFP10398 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARAFP10398 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ARAFP10398 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARAFP10398 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARAFP10398 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARAFP10398 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ARAFP10398 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ARAFP10398 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARAFP10398 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARAFP10398 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ARAFP10398 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARAFP10398 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARAFP10398 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARAFP10398 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARAFP10398 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARAFP10398 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ARAFP10398 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ARAFP10398 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ARAFP10398 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ARAFP10398 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ARAFP10398 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARAFP10398 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ARAFP10398 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ARAFP10398 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ARAFP10398 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARAFP10398 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARAFP10398 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARAFP10398 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARAFP10398 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ARAFP10398 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARAFP10398 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARAFP10398 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARAFP10398 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ARAFP10398 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARAFP10398 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARAFP10398 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARAFP10398 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARAFP10398 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARAFP10398 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ARAFP10398 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARAFP10398 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARAFP10398 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARAFP10398 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARAFP10398 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARAFP10398 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ARAFP10398 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARAFP10398 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARAFP10398 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ARAFP10398 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARAFP10398 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARAFP10398 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARAFP10398 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ARAFP10398 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms