Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM63AO94886 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TMEM63AO94886 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TMEM63AO94886 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TMEM63AO94886 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms