Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ALDH1A2O94788 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ALDH1A2O94788 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ALDH1A2O94788 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 187.6 ms