Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCATO75600 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCATO75600 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCATO75600 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GCATO75600 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCATO75600 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCATO75600 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCATO75600 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GCATO75600 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCATO75600 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GCATO75600 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GCATO75600 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GCATO75600 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCATO75600 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCATO75600 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCATO75600 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCATO75600 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCATO75600 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GCATO75600 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCATO75600 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCATO75600 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCATO75600 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCATO75600 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GCATO75600 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GCATO75600 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCATO75600 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCATO75600 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GCATO75600 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCATO75600 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCATO75600 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCATO75600 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCATO75600 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GCATO75600 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCATO75600 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCATO75600 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCATO75600 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCATO75600 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GCATO75600 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GCATO75600 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
GCATO75600 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCATO75600 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCATO75600 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCATO75600 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
GCATO75600 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GCATO75600 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCATO75600 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GCATO75600 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GCATO75600 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCATO75600 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCATO75600 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GCATO75600 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCATO75600 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCATO75600 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCATO75600 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCATO75600 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCATO75600 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GCATO75600 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GCATO75600 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCATO75600 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCATO75600 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCATO75600 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCATO75600 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GCATO75600 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GCATO75600 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GCATO75600 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
GCATO75600 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCATO75600 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCATO75600 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCATO75600 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCATO75600 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCATO75600 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GCATO75600 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GCATO75600 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GCATO75600 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms