Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN5O75503 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN5O75503 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CLN5O75503 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CLN5O75503 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CLN5O75503 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN5O75503 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN5O75503 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN5O75503 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN5O75503 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CLN5O75503 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN5O75503 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN5O75503 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN5O75503 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CLN5O75503 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CLN5O75503 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CLN5O75503 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN5O75503 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN5O75503 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN5O75503 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CLN5O75503 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN5O75503 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CLN5O75503 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN5O75503 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN5O75503 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN5O75503 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CLN5O75503 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN5O75503 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN5O75503 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN5O75503 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN5O75503 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN5O75503 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CLN5O75503 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CLN5O75503 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CLN5O75503 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN5O75503 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN5O75503 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN5O75503 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN5O75503 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CLN5O75503 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CLN5O75503 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN5O75503 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN5O75503 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN5O75503 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN5O75503 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CLN5O75503 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CLN5O75503 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms