Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF40AO75400 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PRPF40AO75400 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PRPF40AO75400 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PRPF40AO75400 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms