Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

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Length 271 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTDSP2O14595 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSP2O14595 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CTDSP2O14595 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CTDSP2O14595 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP2O14595 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP2O14595 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP2O14595 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CTDSP2O14595 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTDSP2O14595 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSP2O14595 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTDSP2O14595 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP2O14595 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP2O14595 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP2O14595 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP2O14595 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTDSP2O14595 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTDSP2O14595 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CTDSP2O14595 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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