Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F3O00716 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F3O00716 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F3O00716 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F3O00716 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F3O00716 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F3O00716 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F3O00716 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F3O00716 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F3O00716 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F3O00716 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F3O00716 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F3O00716 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F3O00716 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F3O00716 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F3O00716 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F3O00716 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F3O00716 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F3O00716 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F3O00716 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F3O00716 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F3O00716 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F3O00716 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F3O00716 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F3O00716 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F3O00716 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F3O00716 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F3O00716 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F3O00716 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F3O00716 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F3O00716 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F3O00716 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
E2F3O00716 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F3O00716 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F3O00716 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
E2F3O00716 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
E2F3O00716 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F3O00716 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
E2F3O00716 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F3O00716 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F3O00716 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F3O00716 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
E2F3O00716 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F3O00716 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F3O00716 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F3O00716 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
E2F3O00716 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms