Protein–RNA interactions for Protein: H3BSU7

TMX2-CTNND1, TMX2-CTNND1 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TMX2-CTNND1H3BSU7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMX2-CTNND1H3BSU7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMX2-CTNND1H3BSU7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 544 ms