Protein–RNA interactions for Protein: A6NIK2

LRRC10B, Leucine-rich repeat-containing protein 10B, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC10BA6NIK2 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LRRC10BA6NIK2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRC10BA6NIK2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC10BA6NIK2 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms