Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVL5

Uncharacterized protein FLJ43738 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A1B0GVL5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1B0GVL5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
A0A1B0GVL5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
A0A1B0GVL5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
A0A1B0GVL5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
A0A1B0GVL5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms