Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YXV3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YXV3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
A0A0J9YXV3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
A0A0J9YXV3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
A0A0J9YXV3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms