Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y385

UBE2J1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J1Q9Y385 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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UBE2J1Q9Y385 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
UBE2J1Q9Y385 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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