Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATP8A1Q9Y2Q0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ATP8A1Q9Y2Q0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms