Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y252

RNF6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF6Q9Y252 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RNF6Q9Y252 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms