Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LIPT1Q9Y234 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LIPT1Q9Y234 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms