Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
THSD7AQ9UPZ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms