Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNL1Q9UK58 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNL1Q9UK58 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms