Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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RABGEF1Q9UJ41 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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RABGEF1Q9UJ41 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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RABGEF1Q9UJ41 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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RABGEF1Q9UJ41 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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