Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATPIF1Q9UII2 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ATPIF1Q9UII2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms