Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CHRNA9Q9UGM1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms