Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABCF2Q9UG63 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms