Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHRF1Q9P1Y6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHRF1Q9P1Y6 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms