Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
IFT57Q9NWB7 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
IFT57Q9NWB7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms