Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SNX15Q9NRS6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms