Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
DUOX2Q9NRD8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms