Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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HMG20AQ9NP66 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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HMG20AQ9NP66 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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